A Missão de uma empresa expressa o motivo pelo qual ela foi criada e a razão de sua existência. A missão da CONPAVet Jr. é:

 

"Nossa missão é conectar a universidade ao meio rural por meio de consultoria e assistência técnica a pequenos e médios produtores rurais, contando com o apoio de professores da EVZ/UFG, visando a praticidade e acessibilidade dos serviços aos clientes. Além disso, oferecemos capacitações e eventos como cursos e palestras, com o objetivo de desenvolver de maneira pessoal e profissional de nossos membros, bem como dos demais estudantes de medicina veterinária e zootecnia."